移転しました
http://coela.org に移転しました
TogoWS REST
中尾さんのブログ読んでたらtogowsってRESTサービスを知った。
これ結構便利じゃね？統合DBっぽいぞ！
このHPの例だと
http://togows.dbcls.jp/entry/pubmed/16381885
http://togows.dbcls.jp/entry/uniprot/A1AG1_HUMAN,A1AG1_MOUSE
等で各種のDBにアクセスできる。ローカルでDBもたなくてもさくっと解析が出来そう。
http://togows.dbcls.jp/site/en/rest.html
新生活の概要
- 女の子が伝説のポケモン並みにレア。
- バスは基本的に１時間に一本。終バスは８時ぐらいに終わる。
- 寮から最寄りの駅まで徒歩３０分ぐらい。
- 街灯はデフォルトでは存在しない。夜コンビニに行こうと思ったら暗過ぎて泣けてきた。
- 大学周辺に娯楽施設は皆無。DVDのレンタル屋さんが一件存在。
- 周りは見渡す限りの緑。というか、ここは山。
- 道路は結構狭い。
- 道は大抵坂道。傾斜が急。
- 寮は研究室まで（大学までじゃなくて）徒歩３分。
- 寮は５畳半だけど、備え付けのベッドと机が４疂ぐらい占めている。
僕は生き残る事ができるのか！！
でも授業とかは面白そう。歩くロボットは前の大学にはいなかった。
screen saver
昨日友達とスクリーンセーバーの話になった。彼はwindows使用者だったから未来派図画工作のスクリーンセーバー入れられなくて悔しがってた。
http://tomahawkfield.sakura.ne.jp/archives/2008/10/top-10-mac-screen-savers.html
これのMovingPhotos3Dはcore animationを使って昔やろうとしていた事に近い気がする。
Mondrianum
後輩に教えてもらった、macにadobe@kulerで提供しているカラースキームをインストールできるソフト
http://lithoglyph.com/mondrianum/
CPANを自分のホームに設定する方法
シェルでcpanって打って出る初期設定のときに
Every Makefile.PL is run by perl in a separate process. Likewise we
run ‘make’ and ‘make install’ in processes. If you have any
parameters (e.g. PREFIX, LIB, UNINST or the like) you want to pass
to the calls, please specify them here.
If you don’t understand this question, just press ENTER.
Parameters for the ‘perl Makefile.PL’ command?
Typical frequently used settings:
PREFIX=~/perl non-root users (please see manual for more hints)
Your choice:
ここをPREFIX = ~/perlとかにしてやる
初期設定ミスった場合は
o conf makepl_arg PREFIX=~/perl
o conf init
でどうにかなるかも
参考
http://d.hatena.ne.jp/masahi6/20071220/1198133817
http://norainu.net/mt/archives/2004/09/cpan.html
map2slimの使い方
GO Slimの使い方(map2slim)
map2slim [goslim.obo] [go.obo] [FlyBase形式のファイル.fb] > [output.txt]
FlyBase形式のファイルはこんな感じで書く
[database名]\t[proteinIDなど]\t\t\t[GO]\t\t\t\t[GO type]\n
[GO type]の種類
P: biological process
F: molecular function
C: cellular process
もうちょっとマシな方法は無いのかなぁ
参考
http://web.sfc.keio.ac.jp/~qm/qm/index.php?map2slim%A4%CE%BB%C8%A4%A4%CA%FD
http://www.geneontology.org/GO.slims.shtml
http://search.cpan.org/~cmungall/go-perl/scripts/map2slim
macにgnuplotをインストールする方法
OSX Leopardにソースからgnuplotを入れる方法。
macのバイナリじゃなんか駄目だった事があった気がする。
たしかperlの一部のモジュールから叩けないのかな。
基本的に参考の下の方に従って、guplotとreadline入れる時だけ上のページを参考にした
参考
http://macwiki.sourceforge.jp/wiki/index.php/gnuplot
http://www.cbrc.jp/~tominaga/tips/osx_gnuplot.html
direct_delb.jsを俺の環境で動くようにする
direct_delb.jsが毎回パスワード聞いてきてうざかったから
var logins = passwordManager.findLogins({}, ‘https://api.del.icio.us’, ”, ‘del.icio.us API’);
にしたら直った。
vimperatorのステータスバーに要素を移動
ステータスバーに要素を移動する際に今は.vimperatorrc個別に書いてるけど
migratestatusbar.js
http://d.hatena.ne.jp/janus_wel/20081127/1227807826
使った方がいいかも。
参考
http://d.hatena.ne.jp/teramako/20071205/p1
http://d.hatena.ne.jp/eclipse-a/20081027/1225115887
http://d.hatena.ne.jp/pekepekesamurai/20081029
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