map2slimの使い方

GO Slimの使い方(map2slim)

map2slim [goslim.obo] [go.obo] [FlyBase形式のファイル.fb] > [output.txt]

FlyBase形式のファイルはこんな感じで書く

[database名]\t[proteinIDなど]\t\t\t[GO]\t\t\t\t[GO type]\n

[GO type]の種類
P: biological process
F: molecular function
C: cellular process

もうちょっとマシな方法は無いのかなぁ

参考

http://web.sfc.keio.ac.jp/~qm/qm/index.php?map2slim%A4%CE%BB%C8%A4%A4%CA%FD

http://www.geneontology.org/GO.slims.shtml

http://search.cpan.org/~cmungall/go-perl/scripts/map2slim